DEScan2

DOI:10.18129 / B9.bioc.DEScan2

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见DEScan2．

差异富集扫描2

Bioconductor版本:3.8

集成峰值和差分调用器，专门为广泛的表观基因组信号设计。

作者:Dario Righelli [aut, cre]， John Koberstein [aut]， Bruce Gomes [aut]， Nancy Zhang [aut]， Claudia Angelini [aut]， Lucia Peixoto [aut]， Davide Risso [aut]

维护者:Dario Righelli < Dario。Righelli在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“DEScan2”)

超文本标记语言	R脚本	DEScan2装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道，表观遗传学，ImmunoOncology，PeakDetection，测序，软件
版本	1.2.1 "
在Bioconductor	BioC 3.7 (R-3.5)(一年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.5)，GenomicRanges
进口	BiocParallel，BiocGenerics，ChIPpeakAnno，data.table，DelayedArray，GenomeInfoDb，GenomicAlignments，胶水，IRanges，plyr，Rcpp(> = 0.12.13),rtracklayer，S4Vectors，SummarizedExperiment，工具，utils
链接	Rcpp，RcppArmadillo
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat，刨边机，limma，EDASeq，RUVSeq，RColorBrewer，statmod
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	DEScan2_1.2.1.tar.gz
Windows二进制	DEScan2_1.2.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	DEScan2_1.2.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DEScan2
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DEScan2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DEScan2/
软件包下载报告	下载数据