这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见解读.
Bioconductor版本:3.8
用于破译和管理生物序列的工具集。
作者:Erik Wright
维护者:Erik Wright
引文(从R内,输入引用(“破译”)
):
要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("DECIPHER")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“破译”)
R脚本 | 序列进行分类 | |
R脚本 | 设计特定组的FISH探针 | |
R脚本 | 设计特定群体引物 | |
R脚本 | 微阵列探针设计 | |
R脚本 | 设计产生组特定签名的引物 | |
R脚本 | 寻找嵌合序列 | |
R脚本 | 开始解密 | |
R脚本 | R中多序列对齐的艺术 | |
参考手册 |
biocViews | 对齐,聚类,DataImport,遗传学,ImmunoOncology,微阵列,微生物组,质量控制,测序,软件,可视化,WholeGenome,qPCR |
版本 | 2.10.2 |
在Bioconductor | BioC 2.9 (R-2.14)(7.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.3.0),Biostrings(> = 2.35.12),RSQLite(>= 1.1),统计,并行 |
进口 | 方法,DBI,S4Vectors,IRanges,XVector |
链接 | Biostrings,S4Vectors,IRanges,XVector |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | AssessORF |
进口我 | AssessORFData,metagenomeFeatures,openPrimeR |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | DECIPHER_2.10.2.tar.gz |
Windows二进制 | DECIPHER_2.10.2.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | DECIPHER_2.10.2.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DECIPHER |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DECIPHER |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DECIPHER/ |
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