解读

DOI:10.18129 / B9.bioc.DECIPHER

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见解读

用于策划、分析和操纵生物序列的工具

Bioconductor版本:3.8

用于破译和管理生物序列的工具集。

作者:Erik Wright

维护者:Erik Wright

引文(从R内,输入引用(“破译”)):

安装

要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("DECIPHER")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“破译”)

PDF R脚本 序列进行分类
PDF R脚本 设计特定组的FISH探针
PDF R脚本 设计特定群体引物
PDF R脚本 微阵列探针设计
PDF R脚本 设计产生组特定签名的引物
PDF R脚本 寻找嵌合序列
PDF R脚本 开始解密
PDF R脚本 R中多序列对齐的艺术
PDF 参考手册

细节

biocViews 对齐聚类DataImport遗传学ImmunoOncology微阵列微生物组质量控制测序软件可视化WholeGenomeqPCR
版本 2.10.2
在Bioconductor BioC 2.9 (R-2.14)(7.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.3.0),Biostrings(> = 2.35.12),RSQLite(>= 1.1),统计,并行
进口 方法,DBIS4VectorsIRangesXVector
链接 BiostringsS4VectorsIRangesXVector
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 AssessORF
进口我 AssessORFDatametagenomeFeaturesopenPrimeR
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 DECIPHER_2.10.2.tar.gz
Windows二进制 DECIPHER_2.10.2.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) DECIPHER_2.10.2.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DECIPHER
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DECIPHER
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/DECIPHER/
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文档»

Bioconductor

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网