分类

doi:10.18129/b9.bioc.classifyr

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅分类

用于交叉验证分类问题的框架,应用于差异性和差异分配测试

生物导体版本:3.8

该软件在R中为分类的框架形成了四个阶段。数据转换,特征选择,分类器培训和预测。可变类型和名称的要求是固定的,但是也可以提供用于功能的专门变量。分类框架包裹在驱动程序循环中,可重复执行许多交叉验证方案。包括差异表达,差异性和差异分布的功能。用户可以通过创建框架的接口来开发其他功能。

作者:Dario Strbenac,John Ormerod,Graham Mann,Jean Yang

维护者:dario strbenac

引用(从r内,输入引用(“分类”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ classifyr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ classifyr”)

html R脚本 分类包的简介
html R脚本 示例:为K-NN分类器创建包装函数
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 分类,,,,软件,,,,生存
版本 2.2.6
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(4。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.5.0),方法,S4VECTORS(> = 0.18.0),多亚sayExexperiment(> = 1.6.0),生物比较
进口 Locfit,网格,utils,plyr
链接
建议 林玛,,,,GeneFilter,,,,EDGER,,,,,,,,rmixmod,,,,GGPLOT2(> = 3.0.0),栅格(> = 2.0.0),牛仔图,,,,生物使用,,,,pamr,,,,poiclaclu,,,,甲状旁腺,,,,尼特,,,,htmltools,,,,gtable,,,,,,,,E1071,,,,rmarkDown,,,,iranges,,,,Randomforest,,,,鲁棒,,,,Glmnet,,,,班级
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 classifyr_2.2.6.tar.gz
Windows二进制 classifyr_2.2.6.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) classifyr_2.2.6.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/classifyr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/classifyr
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/classifyr/
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