ChIPsim

DOI:10.18129 / B9.bioc.ChIPsim

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见ChIPsim．

模拟ChIP-seq实验

Bioconductor版本:3.8

ChIP-seq数据模拟的一般框架。虽然目前主要集中在核小体定位包的设计，以支持不同类型的实验。

作者:Peter Humburg

维护者:Peter Humburg

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("ChIPsim")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ChIPsim”)

PDF	R脚本	模拟ChIP-seq实验
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq，基础设施，软件
版本	1.36.0
在Bioconductor	BioC 2.5 (R-2.10)(9.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	Biostrings(> = 2.29.2)
进口	IRanges，XVector，Biostrings，ShortRead，图形，方法，统计，utils
链接
建议	actuar，动物园
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ChIPsim_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	ChIPsim_1.36.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ChIPsim_1.36.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChIPsim
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ChIPsim
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ChIPsim/
软件包下载报告	下载数据