chipexoqual

doi:10.18129/b9.bioc.chipexoqual

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅chipexoqual

chipexoqual

生物导体版本:3.8

带有质量控制管道的包装芯片exo/nexus数据。

作者:Rene Welch,Dongjun Chung,Sunduz Keles

维护者:Rene Welch

引用(从r内,输入引用(“ chipexoqual”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ chipexoqual”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Chipexoqual”)

html R脚本 小插图标题
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 结盟,,,,chipseq,,,,覆盖范围,,,,QualityControl,,,,测序,,,,软件,,,,转录,,,,可视化
版本 1.6.0
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(2年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.4.0),基因组签名(> = 1.0.1)
进口 方法,utils,GenomeInfodB,统计生物比较,,,,基因组机(> = 1.14.4),GGPLOT2(> = 1.0),Data.Table(> = 1.9.6),rsamtools(> = 1.16.1),iranges(> = 1.6),S4VECTORS(> = 0.8),Biovizbase(> = 1.18),扫帚(> = 0.4),rcolorbrewer(> = 1.1),dplyr(> = 0.5),(> = 0.4.0),维里迪斯(> = 0.3),Hexbin(> = 1.27),rmarkDown
链接
建议 chipexoqualexample(> = 0.99.1),尼特(> = 1.10),生物使用,,,,栅格(> = 2.2),测试
系统要求
增强
URL https:github.com/keleslab/chipexoqual
BugReports https://github.com/welch16/chipexoqual/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 chipexoqual_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 chipexoqual_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) chipexoqual_1.6.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipexoqual
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/chipexoqual
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/chipexoqual/
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