该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅chipexoqual。
生物导体版本:3.8
带有质量控制管道的包装芯片exo/nexus数据。
作者:Rene Welch,Dongjun Chung,Sunduz Keles
维护者:Rene Welch
引用(从r内,输入引用(“ chipexoqual”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ chipexoqual”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Chipexoqual”)
html | R脚本 | 小插图标题 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 结盟,,,,chipseq,,,,覆盖范围,,,,QualityControl,,,,测序,,,,软件,,,,转录,,,,可视化 |
版本 | 1.6.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.5(R-3.4)(2年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 3.4.0),基因组签名(> = 1.0.1) |
进口 | 方法,utils,GenomeInfodB,统计生物比较,,,,基因组机(> = 1.14.4),GGPLOT2(> = 1.0),Data.Table(> = 1.9.6),rsamtools(> = 1.16.1),iranges(> = 1.6),S4VECTORS(> = 0.8),Biovizbase(> = 1.18),扫帚(> = 0.4),rcolorbrewer(> = 1.1),dplyr(> = 0.5),秤(> = 0.4.0),维里迪斯(> = 0.3),Hexbin(> = 1.27),rmarkDown |
链接 | |
建议 | chipexoqualexample(> = 0.99.1),尼特(> = 1.10),生物使用,,,,栅格(> = 2.2),测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https:github.com/keleslab/chipexoqual |
BugReports | https://github.com/welch16/chipexoqual/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | chipexoqual_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | chipexoqual_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | chipexoqual_1.6.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipexoqual |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/chipexoqual |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/chipexoqual/ |
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