cancersubtypes
doi：10.18129/b9.bioc.cancersubtypes
该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅cancersubtypes。
基于多个基因组数据集的癌症亚型识别，验证和可视化
生物导体版本：3.8
cancersubtypes整合了用于癌症亚型鉴定的当前常见计算生物学方法，并为基于癌症亚型分析的多摩变数据提供了标准化的框架，例如基因表达，miRNA表达，DNA甲基化等。
作者：taosheng xu
维护者：taosheng xu
引用（从r内，输入引用（“ cancersubtypes”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ cancersubtypes”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ cancersubtypes”）
| html | R脚本 | cancersubtypes |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 聚类，，，，基因表达，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.4（R-3.3）（2。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 3.4），sigclust，，，，NMF |
| 进口 | Snftool，，，，iCluster，，，，簇，，，，算，，，，林玛，，，，共识ClusterPlus，grdevices，生存 |
| 链接 | |
| 建议 | 生物基因，，，，运行，，，，尼特，，，，rtcga.mrna，，，，rtcga.Clinical |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/taoshengxu/cancersubtypes |
| BugReports | https://github.com/taoshengxu/cancersubtypes/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | cancersubtypes_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | cancersubtypes_1.8.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | cancersubtypes_1.8.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cancersubtypes |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/cancersubtypes |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/cancersubtypes/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
