cnpbayes

doi:10.18129/b9.bioc.cnpbayes

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅cnpbayes

拷贝数多态性的贝叶斯混合模型

生物导体版本:3.8

用于批处理效果和拷贝数的贝叶斯分层混合模型。

作者:Stephen Cristiano,Robert Scharpf和Jacob Carey

维护者:jacob Carey

引用(从r内,输入引用(“ cnpbayes”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ cnpbayes”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ cnpbayes”)

PDF R脚本 实施贝叶斯混合模型以进行拷贝数估计
PDF R脚本 CNPBAYES软件包的概述
PDF R脚本 CNPBAYES软件包的概述
PDF 参考手册

细节

生物浏览 贝叶斯,,,,库务,,,,软件
版本 1.12.0
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(3。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.4.0),iranges,,,,基因组机
进口 RCPP(> = 0.12.1),S4VECTORS,,,,矩阵,,,,rcolorbrewer,,,,gtools,,,,组合,,,,GenomeInfodB(> = 1.11.6),方法,生物基因,图形,统计信息,结尾,,,,总结性特征,,,,mclust,,,,RESHAPE2,,,,GGPLOT2,,,,马格里特,,,,purrr,,,,花花公子,,,,dplyr,,,,蒂布尔,,,,
链接 RCPP
建议 测试,,,,尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,生物检查,,,,大量的,,,,香草,,,,平淡无奇
系统要求
增强
URL https://github.com/scristia/cnpbayes
BugReports https://github.com/scristia/cnpbayes/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 cnpbayes_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 cnpbayes_1.12.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) cnpbayes_1.12.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cnpbayes
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/cnpbayes
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/cnpbayes/
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