CGHnormaliter

DOI:10.18129 / B9.bioc.CGHnormaliter

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见CGHnormaliter．

不平衡像差阵列CGH数据的归一化。

Bioconductor版本:3.8

阵列比较基因组杂交(aCGH)数据的规范化和集中化。该算法采用迭代过程，有效地消除了拷贝数不平衡的影响。这可以更可靠地评估副本数量变更(cna)。

作者:Bart P.P. van Houte, Thomas W. Binsl, Hannes Hettling

维护者:Bart P.P. van Houte

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CGHnormaliter")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CGHnormaliter”)

PDF	R脚本	CGHnormaliter
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列，预处理，软件
版本	1.36.0
在Bioconductor	BioC 2.5 (R-2.10)(9.5年)
许可证	GPL (>= 3)
取决于	CGHcall(> = 2.17.0),CGHbase(> = 1.15.0)
进口	Biobase，CGHbase，CGHcall，方法，统计，utils
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	CGHnormaliter_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	CGHnormaliter_1.36.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	CGHnormaliter_1.36.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CGHnormaliter
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CGHnormaliter
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CGHnormaliter/
软件包下载报告	下载数据