CAMTHC

DOI:10.18129 / B9.bioc.CAMTHC

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见CAMTHC．

组织异质性表征混合物的凸分析

Bioconductor版本:3.8

用混合物的凸分析(CAM)来描述组织异质性的R包。它为CAM对混合表达谱进行无监督反褶积提供了基本功能，为理解亚群体特异性结果提供了辅助功能。它还实现了基于分子标记、S矩阵或A矩阵的先验知识进行监督反褶积的功能。结合来自CAM和先验知识的分子标记可以实现混合物的半监督反褶积。

作者:陈璐璐

维护人员:Lulu Chen

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("CAMTHC")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CAMTHC”)

超文本标记语言	R脚本	CAMTHC用户手册
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBiology，GeneExpression，软件
版本	1.0.0
在Bioconductor	BioC 3.8 (R-3.5)(0.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.5)
进口	方法,rJava，BiocParallel统计数据,Biobase，SummarizedExperiment，corpcor，几何，NMF，DMwR，pcaPP，apcluster、图形
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle，testthat，GEOquery，rgl
SystemRequirements	Java (>= 1.8)
增强了
URL
BugReports	https://github.com/Lululuella/CAMTHC/issues
全靠我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	CAMTHC_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	CAMTHC_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	CAMTHC_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CAMTHC
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CAMTHC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CAMTHC/
软件包下载报告	下载数据