生物比较

doi:10.18129/b9.bioc.biocparallel

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅生物比较

用于并联评估的生物导体设施

生物导体版本:3.8

该软件包提供了修改的版本和新的功能实现,用于并行评估,该功能量身定制,可用于生物导体对象。

作者:Bioconductor软件包维护者[CRE],Martin Morgan [AUT],Valerie Obenchain [AUT],Michel Lang [aut],Ryan Thompson [aut],Nitesh Turaga [aut]

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

引用(从r内,输入引用(“ BioCparalleal”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ biocparallel”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ BioCparalleal”)

PDF R脚本 1.生物比较简介
PDF R脚本 2. Batchtoolsparam简介
PDF R脚本 3.错误,日志和调试
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基础设施,,,,软件
版本 1.16.6
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(5。5年)
执照 GPL-2 |GPL-3
要看 方法
进口 统计,utils,徒劳, 平行,
链接 BH
建议 生物基因, 工具,foreach,,,,batchjobs,,,,bbmisc,,,,多帕尔,,,,rmpi,,,,基因组机,,,,rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,变体,,,,rsamtools,,,,基因组签名,,,,Shortread,,,,CodeTools,,,,运行,,,,生物使用,,,,尼特,,,,批处理,,,,Data.Table
系统要求 C ++ 11
增强
URL https://github.com/bioconductor/biocparallel
BugReports https://github.com/bioconductor/biocparallel/issues
取决于我 培根,,,,清楚,,,,生物脑,,,,红衣主教,,,,分类,,,,clusterSeq,,,,共识,,,,copywriter,,,,CSAW,,,,Cydar,,,,延迟,,,,dexseq,,,,dmchmm,,,,doppelgangr,,,,液滴,,,,Genomicfiles,,,,Hireadsprocessor,,,,检查,,,,mbased,,,,metagene,,,,示波器,,,,校长,,,,PCAN,,,,proloc,,,,rnaseqgene,,,,RQC,,,,评分,,,,斯克兰,,,,测序,,,,Shortread,,,,西格克,,,,Simplesinglecell,,,,基质4,,,,总结,,,,SVA,,,,XCMS
进口我 Abseqr,,,,辅助,,,,ALDEX2,,,,扩增器,,,,ASIC,,,,Baynorm,,,,生物剂,,,,bionetstat,,,,Biotmle,,,,BSSEQ,,,,Cagefightr,,,,卡格,,,,坎特克,,,,蜂窝监测器,,,,chipexoqual,,,,chipqc,,,,Chromswitch,,,,Chromvar,,,,COGAPS,,,,共识,,,,contibait,,,,Coseq,,,,CPVSNP,,,,CRISPRSEEK,,,,crisprvariants,,,,DCGSA,,,,分解疾病,,,,延迟的matrixstats,,,,德芬德,,,,DESCAN2,,,,deseq2,,,,desingle,,,,差异,,,,DMRSEQ,,,,剂量,,,,Drimseq,,,,EasyRnaseq,,,,犹太人,,,,Erma,,,,ERSSA,,,,fgsea,,,,Findmyfriends,,,,FlowCatchr,,,,gdcrnatools,,,,Genogam,,,,基因组签名,,,,Genotypeeval,,,,GMAPR,,,,GSEABENCHMARKER,,,,Guideseq,,,,H5VC,,,,Hiccompare,,,,htseqgenie,,,,htsfilter,,,,Iasva,,,,冰茶,,,,理想的,,,,ihwpaper,,,,IMAS,,,,冲动2,,,,inpas,,,,兴趣,,,,电离,,,,IPO,,,,IVAS,,,,接口,,,,Kinswingr,,,,谱系,,,,loci2path,,,,Lowmaca,,,,Macpet,,,,McBiclust,,,,化合物,,,,甲基化,,,,甲基硫酸,,,,methyvim,,,,metnet,,,,Migsa,,,,Minfi,,,,Motifbreakr,,,,mpranalyze,,,,MSNBase,,,,多希克科姆,,,,nbsplice,,,,PBase,,,,PBCMC,,,,Powerexplorer,,,,profia,,,,QDNASEQ,,,,qpgraph,,,,QSEA,,,,,,,,叙事,,,,REMP,,,,RJMCMCN核小体,,,,rsamtools,,,,Ruvcorr,,,,SCDD,,,,SCDE,,,,scnorm,,,,烤饼,,,,Scoreinvhap,,,,颈背,,,,sigfeature,,,,唱歌,,,,Snphood,,,,soggi,,,,飞溅,,,,剪接图,,,,Srnadiff,,,,tarseqqc,,,,TFBSTOOLS,,,,tmixclust,,,,特雷娜,,,,时髦的,,,,tsrchitect,,,,TVTB,,,,txreginfra,,,,变体滤波器,,,,变体工具,,,,Zinbwave
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链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 biocparallel_1.16.6.tar.gz
Windows二进制 biocparallel_1.16.6.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) biocparallel_1.16.6.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biocparallel
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/biocparallel
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/biocparallel/
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