BGEEDB
doi：10.18129/b9.bioc.bgeedb
该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅BGEEDB。
从BGEE数据库检索注释和基因表达数据
生物导体版本：3.8
从BGEE数据库中下载注释和基因表达数据的软件包，以及TopAnat分析：通过表达模式映射到基因的解剖学术语的GO样富集。
作者：Andrea Komljenovic [AUT，CRE]，Julien Roux [AUT，CRE]
维护人员：朱利安·沃尔布雷特（Julien Wollbrett
引用（从r内，输入引用（“ BGEEDB”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ bgeedb”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ bgeedb”）
| html | R脚本 | 小插图标题 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | DataImport，，，，去，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，微阵列，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 2.8.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.3（R-3.3）（3年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 3.3.0），topgo，，，，花花公子 |
| 进口 | Data.Table，，，，rcurl，，，，消化，方法，统计，utils，dplyr，，，，图形，，，，生物酶 |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，生物使用，，，，测试，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/bgeedb/bgeedb_r |
| BugReports | https://github.com/bgeedb/bgeedb_r/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | psygenet2r，，，，丽塔 |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | bgeedb_2.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | bgeedb_2.8.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | bgeedb_2.8.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bgeedb |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/bgeedb |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/bgeedb/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
