BayesPeak

DOI:10.18129 / B9.bioc.BayesPeak

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BayesPeak。

贝叶斯分析ChIP-seq数据

Bioconductor版本:3.8

这个包是一个实现ChIP-seq BayesPeak peak-calling算法的数据。

作者:克里斯蒂安娜Spyrou,乔纳森·凯恩斯,斯达克罗里,安迪•林奇西蒙Tavar \ \ ' {e},

维护人员:乔纳森·凯恩斯<乔纳森。凯恩斯在babraham.ac.uk >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BayesPeak”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“BayesPeak”)

PDF	R脚本	BayesPeak装饰图案
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq,软件
版本	1.34.0
Bioconductor自	BioC 2.6 (r - 2.11)(9年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.14),IRanges
进口	IRanges、图形
链接
建议	BiocStyle、并行
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BayesPeak_1.34.0.tar.gz
Windows二进制	BayesPeak_1.34.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	BayesPeak_1.34.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BayesPeak
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BayesPeak
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BayesPeak/
包下载报告	下载数据