该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅注释。
生物导体版本:3.8
提供用于生成注释软件包及其数据库的代码。生产的包装旨在与AnnotationDBI一起使用。
作者:马克·卡尔森(Marc Carlson),赫维·帕格斯(HervéPagès)
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“注释”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ AnnotationForge”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ AnnotationForge”)
R脚本 | 注释:为自定义注释资源创建选择接口 | |
R脚本 | 创建探针软件包 | |
html | R脚本 | 制作新生物包 |
R脚本 | SQLFORGE:使用标准数据库架构创建新的注释软件包的一种简单方法。 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 注解,,,,基础设施,,,,软件 |
版本 | 1.24.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.11(R-2.15)(6。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 2.7.0),方法,utils,生物基因(> = 0.15.10),生物酶(> = 1.17.0),AnnotationDbi(> = 1.33.14) |
进口 | DBI,,,,rsqlite,,,,XML,,,,S4VECTORS,,,,rcurl |
链接 | |
建议 | Biomart,,,,httr,,,,GenomeInfodB(> = 1.17.1),生物弦,,,,副词,,,,HGU95AV2.DB,,,,Human.DB0,,,,org.hs.eg.db,,,,同性恋,,,,hom.hs.inp.db,,,,go.db,,,,生物使用,,,,尼特,,,,生物管理器 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | AnnotationHubdata,,,,gghhumanmethcancerpanelv1.db,,,,gostats |
建议我 | AnnotationDbi,,,,AnnotationHub |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | AnnotationForge_1.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | AnnotationForge_1.24.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | AnnotationForge_1.24.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/annotationforge |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/注释 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/annotationforge/ |
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