Aneufinder
doi：10.18129/b9.bioc.aneufinder
该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅Aneufinder。
分析单细胞序列数据中的拷贝数变化
生物导体版本：3.8
Aneufinder在单细胞整体基因组测序和链序列数据中实现了用于拷贝数检测，断点检测以及核型和异质性分析的功能。
作者：Aaron Taudt，Bjorn Bakker，David Porubsky
维护者：aaron taudt
引用（从r内，输入引用（“ Aneufinder”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ aneufinder”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Aneufinder”）
| R脚本 | 快速介绍Aneufinder | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 库务，，，，基因组变量，，，，HiddenMarkovModel，，，，免疫学，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件，，，，全媒体 |
| 版本 | 1.10.2 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.3（R-3.3）（3年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 3.5），基因组机，，，，牛仔图，，，，Aneufinderdata |
| 进口 | 方法，UTILS，GRDEVICES，图形，统计信息，foreach，，，，多帕尔，，，，S4VECTORS，，，，GenomeInfodB，，，，iranges，，，，rsamtools，，，，bamsignals，，，，DNACOPIGY，，，，ECP，，，，生物弦，，，，基因组签名，，，，GGPLOT2，，，，RESHAPE2，，，，ggdendro，，，，Ggrepel，，，，重新排序，，，，mclust |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，生物使用，，，，测试，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/ataudt/aneufinder.git |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | aneufinder_1.10.2.tar.gz |
| Windows二进制 | Aneufinder_1.10.2.2.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | Aneufinder_1.10.2.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/aneufinder |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/aneufinder |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/aneufinder/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
