ASpli

DOI:10.18129 / B9.bioc.ASpli

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ASpli。

分析使用RNA-Seq可变剪接

Bioconductor版本:3.8

综合管线的分析使用RNAseq可变剪接。

作者:给曼奇尼,哈维尔·Iserte,马塞洛Yanovsky和爱丽儿Chernomoretz

维护人员:给曼奇尼< emancini在leloir.org.ar >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ASpli”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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PDF	R脚本	分析使用ASpli可变剪接
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细节

biocViews	对齐,AlternativeSplicing,报道,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,GeneExpression,GenomeAnnotation,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,TimeCourse,转录
版本	1.8.1
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(2.5年)
许可证	GPL
取决于	方法、grDevices统计,跑龙套,平行,刨边机
进口	GenomicRanges,GenomicFeatures,BiocGenerics,IRanges,GenomicAlignments,Gviz,S4Vectors,AnnotationDbi,Rsamtools,BiocStyle
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ASpli_1.8.1.tar.gz
Windows二进制	ASpli_1.8.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	ASpli_1.8.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ASpli
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ASpli
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ASpli/
包下载报告	下载数据