工作流包:变体

注释基因组变体

生物导体版本:3.7

读写VCF文件。鉴定变体的结构位置,并计算非同义变体的氨基酸编码变化。使用SIFT和POMPHEN数据库包预测氨基酸编码变化的结果

作者:生物导体包维护者[CRE]

维护者:Bioconductor Package维护者

引文(从R内,输入引文(“变种”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url source(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“变体”)

文件

要查看系统中安装此包版本的可用工作流程,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“变种”)

HTML. r script. 注释基因组变体

细节

Biocviews. AnnotationWorkflow.工作流程
版本 1.2.0
执照 艺术-2.0
依靠 r(> = 3.3.0),VariantAnnotation.cgdv17.org.hs.eg.db.txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.polyphen.hsapiens.dbsnp131
进口
链接到
建议 knRAMAMAMDOW.生物焦
系统要求
加强
URL. https://www.biocumon.org/help/workflows/variants/
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

文件»

生物体

R./cr包裹和文件

支持»

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  • 支持网站- 关于生物导体包的问题
  • 正常词 邮件列表 - 适用于包开发人员bob电竞体育官网