生物导体版本:3.7
读写VCF文件。鉴定变体的结构位置,并计算非同义变体的氨基酸编码变化。使用SIFT和POMPHEN数据库包预测氨基酸编码变化的结果
作者:生物导体包维护者[CRE]
维护者:Bioconductor Package维护者
引文(从R内,输入引文(“变种”)
):
要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url source(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“变体”)
要查看系统中安装此包版本的可用工作流程,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“变种”)
HTML. | r script. | 注释基因组变体 |
Biocviews. | AnnotationWorkflow.那工作流程 |
版本 | 1.2.0 |
执照 | 艺术-2.0 |
依靠 | r(> = 3.3.0),VariantAnnotation.那cgdv17.那org.hs.eg.db.那txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.那bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.那polyphen.hsapiens.dbsnp131 |
进口 | |
链接到 | |
建议 | kn那RAMAMAMDOW.那生物焦 |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | https://www.biocumon.org/help/workflows/variants/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接给我 | |
建立报告 |