工作流包:注释

基因组注释资源

Bioconductor版本:3.7

注释资源在Bioconductor项目中占很大比例。此外,还可以使用特定的软件包访问各种各样的在线资源。本演练将描述这些资源中最流行的一些,并提供一些关于如何使用它们的高级示例。

作者:Marc RJ Carlson [aut], Herve Pages [aut], Sonali Arora [aut], Valerie Obenchain [aut], Martin Morgan [aut], Bioconductor Package维护者[cre]

维护者:Bioconductor Package维护者< maintainer@bioconductor.org >

引文(从R内,输入引用(“注释”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("annotation")

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的可用工作流,启动R并输入:

browseVignettes(“注释”)

超文本标记语言 R脚本 注释基因组范围
超文本标记语言 R脚本 基因组注释资源

细节

biocViews AnnotationWorkflow工作流
版本 1.2.0
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.3.0),VariantAnnotationAnnotationHubOrganism.dplyrTxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGeneTxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGeneTxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.ensGeneorg.Hs.eg.dborg.Mm.eg.dbHomo.sapiensBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19biomaRtBSgenomeTxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart22
进口
链接
建议 knitrrmarkdownBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL //www.anjoumacpherson.com/help/workflows/annotation/Annotation_Resources/
全靠我
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建议我
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