工作流包:注释
基因组注释资源
Bioconductor版本:3.7
注释资源在Bioconductor项目中占很大比例。此外，还可以使用特定的软件包访问各种各样的在线资源。本演练将描述这些资源中最流行的一些，并提供一些关于如何使用它们的高级示例。
作者:Marc RJ Carlson [aut]， Herve Pages [aut]， Sonali Arora [aut]， Valerie Obenchain [aut]， Martin Morgan [aut]， Bioconductor Package维护者[cre]
维护者:Bioconductor Package维护者< maintainer@bioconductor.org >
引文(从R内，输入引用(“注释”))：
安装
要安装这个包，启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("annotation")
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的可用工作流，启动R并输入:
browseVignettes(“注释”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 注释基因组范围 |
| 超文本标记语言 | R脚本 | 基因组注释资源 |
细节
| biocViews | AnnotationWorkflow，工作流 |
| 版本 | 1.2.0 |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 3.3.0)，VariantAnnotation，AnnotationHub，Organism.dplyr，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.ensGene，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，Homo.sapiens，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，biomaRt，BSgenome，TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart22 |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，rmarkdown，BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | //www.anjoumacpherson.com/help/workflows/annotation/Annotation_Resources/ |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
