工作流包:ExpressionNormalizationWorkflow

基因表达规范化工作流程

Bioconductor版本:3.7

一个广泛的，定制的表达归一化工作流，结合监督归一化的微阵列(SNM)，代理变量分析(SVA)和主方差成分分析，以识别批量效应，并从表达数据中去除它们，以增强检测潜在生物信号的能力。

作者:Karthikeyan Murugesan [aut, cre]， Greg Gibson [sad, ths]

维护者:Karthikeyan Murugesan

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ExpressionNormalizationWorkflow”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的可用工作流，启动R并输入:

browseVignettes(“ExpressionNormalizationWorkflow”)

超文本标记语言

R脚本

基因表达规范化工作流程

细节

biocViews	GeneExpressionWorkflow，工作流
版本	1.4.0
许可证	GPL (> = 3)
取决于
进口	Biobase(> = 2.24.0),limma(> = 3.20.9),lme4(> = 1.1.7),matrixStats(> = 0.10.3),pvca(> = 1.4.0),球形结构(> = 1.12.0),股东价值分析(> = 3.10.0),vsn(> = 3.32.0)
链接
建议	knitr，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/
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构建报告