这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅tissueTreg。
Bioconductor版本:3.7
包提供了准备使用表观基因组(来自TWGBS)和转录组(RNA-seq)从研究中获得的各种组织(PMID Delacher Imbusch 2017: 28783152)。调节性T细胞(Treg细胞)执行两种不同的功能:他们保持自我耐受性,支持器官内稳态Treg细胞分化到专业组织。底层数据集的特征,表观遗传和专业组织Treg细胞转录组修改。
作者:查尔斯Imbusch (aut (cre),迈克尔·Delacher (aut),马库斯Feuerer (aut) Benedikt Brors (aut)
维护人员:查尔斯Imbusch < c。在dkfz.de imbusch >
从内部引用(R,回车引用(“tissueTreg”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“tissueTreg”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“tissueTreg”)
HTML | R脚本 | tissueTreg |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ExperimentData,Mus_musculus_Data,RNASeqData,SequencingData,组织 |
版本 | 1.0.0 |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 3.5) |
进口 | |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,ExperimentHub,bsseq,SummarizedExperiment |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/cimbusch/tissueTreg |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | tissueTreg_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tissueTreg |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ tissueTreg |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/tissueTreg/ |
包下载报告 | 下载数据 |