- 家
- Bioconductor 3.7
- 实验方案
- systemPipeRdata
systemPipeRdata
DOI:10.18129 / B9.bioc.systemPipeRdata
这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅systemPipeRdata。
systemPipeRdata:门店工作流模板和示例数据
Bioconductor版本:3.7
systemPipeRdata是一个辅助包与一个命令生成挥动工作流模板,仅供systemPipeR其母包。后者是一个环境构建端到端分析管道与自动报告生成下一代序列(上天)应用程序,如RNA-Seq RIBO-Seq, ChIP-Seq, VAR-Seq和许多其他人。给出详细的示例使用systemPipeRdata systemPipeR概述的装饰图案。
作者:托马斯Girke
维护人员:托马斯Girke <托马斯。在ucr.edu girke >
从内部引用(R,回车引用(“systemPipeRdata”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“systemPipeRdata”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“systemPipeRdata”)
| HTML | R脚本 | 概述装饰图案 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 自述 | |
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 对齐,ChIPSeq,报道,DataImport,ExperimentData,GeneExpression,GeneSetEnrichment,遗传学,基础设施,MethylSeq,质量控制,RNASeq,单核苷酸多态性,测序 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | 方法 |
| 进口 | BiocGenerics |
| 链接 | |
| 建议 | RUnit,BiocStyle,knitr,rmarkdown,systemPipeR |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/tgirke/systemPipeRdata |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | systemPipeRdata_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/systemPipeRdata |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ systemPipeRdata |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/systemPipeRdata/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
