帕西拉

doi:10.18129/b9.bioc.pasilla

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅帕西拉

Brooks等人的Pasilla敲除RNA-SEQ样品的数据包和人均读数,2011年基因组研究。

生物导体版本:3.7

该软件包提供了从RNA-seq数据中计算出的每个基因的每个读取计数,这些数据是在文章中介绍的,这些数据是“果蝇和哺乳动物之间RNA调节图的保存”,Brooks An,Yang L,Duff MO,Hansen,HansenKD,Park JW,Dudoit S,Brenner SE,Graveley BR,Genome Res。2011年2月; 21(2):193-202,Epub 2010年10月4日,PMID:20921232。实验研究了pasilla的RNAi敲低的影响,果蝇果蝇的哺乳动物Nova1和Nova2的果蝇直系同源物对转录组。软件包小插图描述了此处提供的数据是如何从rna-seq读取序列数据中得出的,这些序列数据由NCBI基因表达式综合在登录号GSM461176到GSM461181提供。

作者:沃尔夫冈·胡伯(Alejandro Reyes)

维护者:Alejandro Reyes

引用(从r内,输入引用(“ pasilla”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ pasilla”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Pasilla”)

html R脚本 数据预处理和数据对象的pasillagenes和pasillaexons的创建
PDF 参考手册

细节

生物浏览 Drosophila_melanogaster_data,,,,实验数据,,,,基因组,,,,rnaseqdata
版本 1.8.0
执照 LGPL
要看 r(> = 3.3.0)
进口
链接
建议 dexseq,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,尼特
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 坏人,,,,deseq,,,,deseq2,,,,dexseq,,,,GeneFilter,,,,基因组机,,,,ihwpaper,,,,pasillabamsubset,,,,地区报告,,,,报告工具
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 pasilla_1.8.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pasilla
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/pasilla
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/pasilla/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网