leeBamViews

DOI:10.18129 / B9.bioc.leeBamViews

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅leeBamViews。

leeBamViews——摘自李2009多个酵母RNAseq样本

Bioconductor版本:3.7

数据从PMID 19096707;原型用于管理多个门店样本

作者:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

维修工:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“leeBamViews”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“leeBamViews”)

PDF	R脚本	管理多个门店与bamViews样本
PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData,RNASeqData,SNPData,Saccharomyces_cerevisiae_Data,SequencingData
版本	1.16.0
许可证	艺术2.0
取决于	R (> = 2.15.0),Biobase,Rsamtools(> = 0.1.50),BSgenome
进口	GenomicRanges,GenomicAlignments、方法
链接
建议	GenomeGraphs,biomaRt,org.Sc.sgd.db,刨边机
SystemRequirements
增强了	多核
URL
取决于我
进口我
建议我	EDASeq
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	leeBamViews_1.16.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/leeBamViews
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ leeBamViews
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/leeBamViews/
包下载报告	下载数据