此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见IHWpaper.
Bioconductor版本:3.7
这个包方便地包装了在IHW预印本中再现数字所需的所有功能,可在biorXiv http://biorxiv.org/content/early/2016/03/30/034330下获得。因此,它是Bioconductor IHW包的配套包。
作者:Nikos Ignatiadis [aut, cre]
维护者:Nikos Ignatiadis < Nikos。Ignatiadis01在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“IHWpaper”)
):
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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“IHWpaper”)
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browseVignettes(“IHWpaper”)
超文本标记语言 | R脚本 | BH解释/可视化 |
超文本标记语言 | R脚本 | 解释热带病研究和培训特别规划 |
超文本标记语言 | R脚本 | 应用于IHW的Grenander Estimator (vs ECDF) |
超文本标记语言 | R脚本 | IHW-Bonferroni模拟 |
超文本标记语言 | R脚本 | 真实数据示例 |
超文本标记语言 | R脚本 | 真实数据示例:1倍权重函数 |
超文本标记语言 | R脚本 | 模拟数据 |
超文本标记语言 | R脚本 | 分层柱状图 |
超文本标记语言 | R脚本 | TDR和pvalue排斥区 |
超文本标记语言 | R脚本 | 权重vs独立过滤 |
参考手册 |
biocViews | ExperimentData,ExpressionData,RNASeqData,ReproducibleResearch |
版本 | 1.7.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.3),IHW |
进口 | Rcpp,统计,样条,方法,utils,DESeq2,SummarizedExperiment,fdrtool,genefilter,qvalue,Biobase,BiocGenerics,BiocParallel,dplyr、网格ggplot2,cowplot |
链接 | Rcpp |
建议 | testthat,RColorBrewer,wesanderson,尺度,gridExtra,BiocStyle,knitr,rmarkdown,气道,pasilla,DESeq,locfdr,tidyr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | IHWpaper_1.7.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IHWpaper |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/IHWpaper |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/IHWpaper/ |
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