HMP16SData

DOI:10.18129 / B9.bioc.HMP16SData

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见HMP16SData．

来自人类微生物组计划的16S rRNA测序数据

Bioconductor版本:3.7

HMP16SData是人类微生物组计划(HMP) 16S rRNA可变区域1-3和3-5测序数据的生物导体实验数据包。原始数据文件从HMP数据分析与协调中心下载。处理后的数据通过ExperimentHub作为summarizeexperiment类对象提供。

作者:Lucas Schiffer < Schiffer。Lucas在gmail.com>，Rimsha Azhar , Marcel Ramos , Ludwig Geistlinger , Levi Waldron

维护者:Lucas Schiffer < Schiffer。Lucas在gmail.com>

安装

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文档

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browseVignettes(“HMP16SData”)

超文本标记语言	R脚本	HMP16SData
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData，Homo_sapiens_Data，MicrobiomeData，ReproducibleResearch，SequencingData
版本	1.0.1
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.5.0)，SummarizedExperiment
进口	AnnotationHub，为了，dplyr，ExperimentHub，kableExtra，knitr，magrittr、方法、readr，S4Vectors，宠物猫,跑龙套
链接
建议	Biobase，BiocCheck，BiocInstaller，BiocStyle，circlize，covr，cowplot，curatedMetagenomicData，dendextend，devtools，ggplot2，gridExtra，还，phyloseq，rmarkdown，roxygen2统计数据,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/waldronlab/HMP16SData
BugReports	https://github.com/waldronlab/HMP16SData/issues
全靠我
进口我
建议我
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包档案

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源包	HMP16SData_1.0.1.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HMP16SData
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HMP16SData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HMP16SData/
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