该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅bsgenome.ptroglodytes.ucsc.pantro3.masked。
生物导体版本:3.7
UCSC(2010年10月Pantro3)提供的PAN Troglodytes(黑猩猩)的完整基因组序列,并存储在生物弦对象中。这些序列与bsgenome.ptroglodytes.ucsc.pantro3中的序列相同,除了每个序列都在顶部有4个后面的掩码:(1)组装间隙的掩码(agaps mask)(agaps mask),(2)Intra Intra Intra-Contig的掩码歧义(Ambmask),(3)RepotMasker(RM Mask)的重复掩码,以及(4)串联重复搜索器(TRF蒙版)的重复掩码。默认情况下,只有agaps和amb掩模是“活动”的。
作者:生物导体开发团队
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
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参考手册 |
生物浏览 | AnnotationData,,,,BSGENOME,,,,遗传学,,,,pan_troglodytes |
版本 | 1.3.99 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | BSGENOME(> = 1.31.8),bsgenome.ptroglodytes.ucsc.pantro3 |
进口 | BSGENOME,,,,bsgenome.ptroglodytes.ucsc.pantro3 |
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源包 | bsgenome.ptroglodytes.ucsc.pantro3.masked_1.3.99.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/bsgenome.ptroglodytes.ucsc.pantro3.masked/ |
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