BSGENOME.MMULATTA.UCSC.RHEMAC2.MASKED

doi:10.18129/b9.bioc.bsgenome.mmulatta.ucsc.rhemac2.masked

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Macaca Mulatta的完整蒙版基因组序列(UCSC版本RHEMAC2)

生物导体版本:3.7

UCSC(Rhemac2,2006年1月)提供的Macaca Mulatta(Rhesus)的完整基因组序列,并存储在生物弦对象中。这些序列与bsgenome.mmulatta.ucsc.rhemac2中的序列相同,除了它们每个序列在顶部都有4个接下来的掩码:(1)组装间隙的掩码(agaps mask)(agaps mask),(2)contra insra Intra contig的掩码歧义(Ambmask),(3)RepotMasker(RM Mask)的重复掩码,以及(4)串联重复搜索器(TRF蒙版)的重复掩码。默认情况下,只有agaps和amb掩模是“活动”的。注意:在UCSC上可用的大多数组件中,对串联重复序列重复序列进行过滤以仅保留含量<= 12的重复序列。但是,该组件省略了过滤器,因此TRF掩码包含所有串联重复序列的结果。

作者:生物导体开发团队

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