BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19

智人全基因组序列(UCSC版本hg19)

Bioconductor版本:3.7

智人(人类)的完整基因组序列由UCSC提供(hg19, 2009年2月)并存储在Biostrings对象中。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

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细节

biocViews AnnotationDataBSgenome遗传学Homo_sapiens
版本 1.4.0
许可证 艺术- 2.0
取决于 BSgenome(> = 1.33.5)
进口 BSgenome
链接
建议 TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 注释BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked嵌合体食典委motifRG测序tra利用变体
进口我 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.maskedChIPCompMADSEQRareVariantVis美国广播公司REMPTCGAWorkflowtrena
建议我 AneuFinderArrayTVATACseqQCBadRegionFinderBasic4CseqBBCAnalyzerbiovizBaseChIPpeakAnnochromVARcnCRISPRseekcustomProDBDNAshapeResATACFDb.FANTOM4.promoters.hg19FDb.UCSC.snp135common.hg19FDb.UCSC.snp137common.hg19gcapcGenomicAlignmentsGenomicFeaturesGenomicRangesGenomicScoresGenVisRggbiogmapRGoogleGenomicsGUIDEseqGvizh5vcInPAS感兴趣IsoformSwitchAnalyzeRkaryoploteRMEDIPSMinimumDistance海市蜃楼motifbreakRmotifmatchrMutationalPatternsORFikOrganismDbiPGAplyrangesqseaR453Plus1ToolboxRariantrGADEMRiboProfilingRsamtoolsRSVSimrtracklayerSGSeq签名者SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608SNPlocs.Hsapiens.dbSNP142.GRCh37SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37连接工具VariantAnnotationwavClusteRXtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37YAPSA
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源包 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19/
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