bsgenome.gaculeatus.ucsc.gasacu1.masked

doi:10.18129/b9.bioc.bsgenome.gaculeatus.ucsc.gasacu1.masked

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Gasterosteus aculeatus(UCSC版本GASACU1)的完整掩盖基因组序列

生物导体版本:3.7

gasterosteus aculeatus(Stickleback)的完整基因组序列,由UCSC(2006年2月1日GasAcu1)提供,并存储在生物弦对象中。这些序列与bsgenome.gaculeatus.ucsc.gasacu1中的序列相同,除了它们每个序列都在顶部具有4个接下来的掩码:(1)组装间隙的掩码(agaps mask)(agaps mask),(2)内部内部的掩模。歧义(Ambmask),(3)RepotMasker(RM Mask)的重复掩码,以及(4)串联重复搜索器(TRF蒙版)的重复掩码。默认情况下,只有agaps和amb掩模是“活动”的。

作者:生物导体开发团队

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