BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3.masked

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3.masked．

黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)全隐藏基因组序列(UCSC版本dm3)

Bioconductor版本:3.7

黑腹果蝇(Fly)的完整基因组序列由UCSC提供(dm3, 2006年4月)并存储在Biostrings对象中。序列与BSgenome.Dmelanogaster.UCSC相同。dm3，除了它们每个上面都有以下4个掩码:(1)装配间隙掩码(AGAPS掩码)，(2)contig内歧义掩码(AMB掩码)，(3)RepeatMasker中的重复掩码(RM掩码)，以及(4)Tandem repeats Finder中的重复掩码(TRF掩码)。默认情况下，只有AGAPS和AMB掩码是“活动的”。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

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文档

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细节

biocViews	AnnotationData，BSgenome，Drosophila_melanogaster，遗传学
版本	1.3.99
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.31.8),BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3
进口	BSgenome，BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3
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源包	BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3.masked_1.3.99.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3.masked/
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