BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam2.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam2.masked

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam2.masked。

完整的蒙面基因组序列犬属狼疮后裔(canFam2 UCSC的版本)

Bioconductor版本:3.7

完整基因组序列犬属狼疮后裔(狗)提供的UCSC (canFam2, 2005年5月)和存储在Biostrings对象。BSgenome.Cfamiliaris.UCSC序列是一样的。canFam2,除了他们每个人上面具后的4:(1)装配间隙的面具(AGAPS面具),(2)的面具intra-contig模棱两可(AMB面具),(3)重复的面具RepeatMasker (RM面具),和(4)串联重复序列的重复的面具仪(扶轮基金会面具)。只有AGAPS和AMB面具默认是“活跃”的。

作者:Bioconductor Dev团队

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

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细节

biocViews	AnnotationData,BSgenome,Canis_familiaris,遗传学
版本	1.3.99
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.31.8),BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam2
进口	BSgenome,BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam2
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源包	BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam2.masked_1.3.99.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam2.masked/
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