AHEnsDbs

DOI:10.18129 / B9.bioc.AHEnsDbs

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见AHEnsDbs

用于AnnotationHub的EnsDbs

Bioconductor版本:3.7

为AnnotationHub提供所有物种的基于EnsDb ensemble的注释数据库。EnsDb SQLite数据库是通过使用Ensembl Perl API的ensembldb包中的函数从Ensembl MySQL数据库中单独生成的。

作者:约翰内斯·雷纳

维护者:Johannes Rainer < Johannes。Rainer在eurac。edu>

引文(从R内,输入引用(“AHEnsDbs”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“AHEnsDbs”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“AHEnsDbs”)

超文本标记语言 R脚本 为AnnotationHub提供EnsDb数据库
PDF 参考手册

细节

biocViews AnnotationData报道DataImport测序
版本 1.0.6
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(>= 3.4),方法,ensembldb(> = 1.99.10)
进口 AnnotationHubData(> = 1.5.24)
链接
建议 BiocStyleknitrAnnotationHub(> = 2.7.13)
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 AHEnsDbs_1.0.6.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/AHEnsDbs/
软件包下载报告 下载数据

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