此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见AHEnsDbs.
Bioconductor版本:3.7
为AnnotationHub提供所有物种的基于EnsDb ensemble的注释数据库。EnsDb SQLite数据库是通过使用Ensembl Perl API的ensembldb包中的函数从Ensembl MySQL数据库中单独生成的。
作者:约翰内斯·雷纳
维护者:Johannes Rainer < Johannes。Rainer在eurac。edu>
引文(从R内,输入引用(“AHEnsDbs”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“AHEnsDbs”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“AHEnsDbs”)
超文本标记语言 | R脚本 | 为AnnotationHub提供EnsDb数据库 |
参考手册 |
biocViews | AnnotationData,报道,DataImport,测序 |
版本 | 1.0.6 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(>= 3.4),方法,ensembldb(> = 1.99.10) |
进口 | AnnotationHubData(> = 1.5.24) |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,AnnotationHub(> = 2.7.13) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | AHEnsDbs_1.0.6.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/AHEnsDbs/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |