版本1.11.1 ------------- o在过滤器优化中从mclapply切换到parLapply。这修复了一个错误“断言失败在kmp_runtime.cpp(6480): __kmp_thread_pool == __null。”也允许并行运行在windows操作系统版本1.7.3 ------------- o逻辑错误修复在PSM FDR计算。在此之前，它忽略了肽到蛋白映射的冗余。现在，在计算FDR之前，蛋白质接入被丢弃，唯一的行被考虑。增加单元测试以覆盖新的PSM FDR计算。1.7.2版本------------- o增加了基于mzR::openIDFile的高性能解析器。1.7.1版本------------- o增加了infer_parsimonious_accessions方法，从1.3.1版本跃迁到1.7.1版本以追赶Bioconductor，修复了reshape2和data之间的冲突。表版本1.3.1 ------------- o S4方法“接入”和“蛋白质”外包到ProtGenerics版本1.1.6 ------------- o增加显式mc.cores参数为“网格”类型的优化o修复修剪到basename在POSIX版本1.1.5 ------------- o总是修剪spectrumFile和databaseFile到basename后从mzIdentML文件读取数据。版本1.1.4 ------------- o赶上mzID包版本1.5.3版本1.1.3 ------------- o更新的数据，文档和单元测试，以反映mzID版本1.1.2 ------------- o id_quality和evaluate_filter可能有多个值的级别参数。默认情况下，这三个都是:“PSM”，“peptide”和“accession”。 The return value for both methods is switched to matrices. o added Laurent Gatto as a contributor Version 1.1.1 ------------- o fix mishandling PSM o use mzR::psms generic Version 1.1.0 ------------- o Bumping versions after creating 3.0 release branch. Version 0.99.3 -------------- o Rcpp back into "Depends" Version 0.99.2 -------------- o Updated Rcpp dependency o Updated contact info to match the bioc-devel mailing list Version 0.99.1 -------------- o Updated dependency on mzID version Version 0.99.0 -------------- o Minor bug fixes o Added unit tests for filter optimization and assessment of non-tryptic and missed cleavages o Version bump for Bioconductor submission Version 0.1.0 -------------- o First release version