西瓜

DOI:10.18129 / B9.bioc.wateRmelon

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见西瓜

Illumina 450甲基化阵列归一化和度量

Bioconductor版本:3.7

15种beta版本和3种性能指标,以及methylumi和minfi包生成的对象的方法。

作者:Leonard C Schalkwyk, Ruth Pidsley, Chloe CY Wong,功能由Nizar Touleimat, Matthieu Defrance, Andrew Teschendorff, Jovana Maksimovic, Tyler Gorrie-Stone, Louis El Khoury贡献

维护者:Leo

引文(从R内,输入引用(“西瓜”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“西瓜”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“西瓜”)

PDF R脚本 \Rpackage{西瓜}包
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DNAMethylation微阵列预处理质量控制软件TwoChannel
版本 1.24.0
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(5.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 2.10),Biobaselimma、方法、matrixStatsmethylumi光民中华民国IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19illuminaio
进口 Biobase
链接
建议 RPMMIlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19IlluminaHumanMethylationEPICmanifest
SystemRequirements
增强了 minfi
URL
全靠我 bigmelonskewr
进口我 冠军ENmix
建议我 RnBeads
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 wateRmelon_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 wateRmelon_1.24.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) wateRmelon_1.24.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/wateRmelon
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/西瓜
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/wateRmelon/
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Bioconductor

R/凹口包和文档

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