vidger

DOI:10.18129 / B9.bioc.vidger

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见vidger．

在R中创建RNAseq数据的快速可视化

Bioconductor版本:3.7

vidger的目的是快速生成信息丰富的可视化，用于从三个广泛使用的工具(Cuffdiff, DESeq2和edgeR)解释差异基因表达结果。

作者:Brandon Monier, Adam McDermaid，秦妈

维护者:Brandon Monier < Brandon。Monier在sdstate。edu>

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“vidger”)

文档

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browseVignettes(“vidger”)

超文本标记语言	R脚本	用ViDGER可视化RNA-seq数据
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，RNASeq，软件，可视化
版本	1.0.0
许可证	GPL-2 |文件LICENSE
取决于	R (>= 3.5)
进口	Biobase，DESeq2，刨边机，knitr，rmarkdown，GGally，ggplot2，尺度统计数据,SummarizedExperiment，tidyr,跑龙套
链接
建议	testthat，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	vidger_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	vidger_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	vidger_1.0.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/vidger
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/vidger
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/vidger/
软件包下载报告	下载数据