tweeDEseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.tweeDEseq

此包适用于Bioconductor的3.7版;有关稳定的、最新的发布版本,请参见tweeDEseq

使用Poisson-Tweedie分布家族的RNA-seq数据分析

Bioconductor版本:3.7

利用分布的Poisson-Tweedie家族分析RNA-seq的差异表达。

作者:Juan R Gonzalez 和米克尔·埃斯纳奥拉在creal的梅斯纳奥拉。cat>(由罗伯特·卡斯特罗贡献<罗伯特。在upf.edu castelo >)

维护者:Juan R Gonzalez

引文(从R中输入引用(“tweeDEseq”)):

安装

要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“tweeDEseq”)

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“tweeDEseq”)

PDF R脚本 使用Poisson-Tweedie分布家族分析RNA-seq数据
PDF 参考手册

细节

biocViews DifferentialExpression,RNASeq,测序,软件,StatisticalMethod
版本 1.26.0
Bioconductor自 BioC 2.9 (R-2.14)(7年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (> = 2.12.0)
进口 质量,limma,刨边机平行,cqn
链接
建议 tweeDEseqCountData,xtable
SystemRequirements
增强了
URL http://www.creal.cat/jrgonzalez/software.htm
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 tweeDEseq_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 tweeDEseq_1.26.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) tweeDEseq_1.26.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tweeDEseq
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ tweeDEseq
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/tweeDEseq/
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