triform

DOI:10.18129 / B9.bioc.triform

此包适用于Bioconductor的3.7版本;有关稳定的最新发布版本，请参见triform．

Triform在转录因子芯片测序数据中发现了富集区域(峰)

Bioconductor版本:3.7

Triform算法使用无模型统计数据来识别TF ChIP测序读数的峰状分布，利用改进的峰定义结合已知的剖面特征。

作者:Karl Kornacker开发者[aut]， Tony Handstad开发者[aut, cre]

维护人员:Thomas Carroll

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("triform")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“triform”)

PDF	R脚本	Triform用户指南
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq，测序，软件
版本	1.22.0
在Bioconductor公司	BioC 2.11 (R-2.15)(6年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 2.11.0)，IRanges，yaml
进口	BiocGenerics，IRanges(> = 2.5.27),yaml
链接
建议	RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	triform_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	triform_1.22.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	triform_1.22.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/triform
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/triform
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/triform/
软件包下载报告	下载数据