transcriptogramer

DOI:10.18129 / B9.bioc.transcriptogramer

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅transcriptogramer。

基于transcriptograms转录分析

Bioconductor版本:3.7

基于transcriptograms转录分析R包,一个项目表达式值的方法来分析转录组一组有序蛋白质,安排这样的概率基因产物参与相同的代谢途径指数随距离的增加而减小两个蛋白质之间的排序。Transcriptograms,因此,全基因组基因表达谱,为细胞代谢提供一个全局视图,而表明基因集的表达改变。

作者:迭戈莫莱斯(aut (cre),罗德里戈Dalmolin (aut)

维修工:极其迭戈< vinx在ufrn.edu.br >

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HTML	R脚本	transcriptogramer用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,GeneSetEnrichment,网络,软件,SystemsBiology,可视化
版本	1.2.1 "
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> = 3.4),方法
进口	biomaRt,data.table,doSNOW,foreach,ggplot2、图形、grDevicesigraph,limma平行,进步,红色的,雪统计数据,topGO
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements	Java运行时环境(> = 6)
增强了
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进口我
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包档案

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源包	transcriptogramer_1.2.1.tar.gz
Windows二进制	transcriptogramer_1.2.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	transcriptogramer_1.2.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/transcriptogramer
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ transcriptogramer
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/transcriptogramer/
包下载报告	下载数据