TrackViewer

doi:10.18129/b9.bioc.TrackViewer

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅TrackViewer

用于绘制优雅互动曲目或棒棒糖图的R/生物导体包,以促进对多摩变数据的综合分析

生物导体版本:3.7

可视化映射的读取与注释作为NGS数据集的轨道层,例如芯片seq,rna-seq,miRNA-seq,dna-seq,SNP和甲基化数据。

作者:Jianhong OU,Yong-Xu Wang,Lihua Julie Zhu

维护者:jianhong ou

引用(从r内,输入引用(“ TrackViewer”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ trackViewer”)

文档

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Browsevignettes(“ TrackViewer”)

html R脚本 TrackViewer Vignette
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 软件,,,,可视化
版本 1.16.1
在生物导体中 Bioc 2.14(R-3.1)(4。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.1.0),grdevices,方法,基因组机, 网格
进口 GenomeInfodB,,,,基因组签名,,,,GenomicFeatures,,,,GVIZ,,,,rsamtools,,,,S4VECTORS,,,,rtracklayer,,,,生物基因,,,,, 工具,iranges,,,,AnnotationDbi,,,,格里姆波特,,,,htmlwidgets,,,,plotrix,,,,rgraphviz,,,,互动集,,,,图形
链接
建议 Biomart,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,运行,,,,org.hs.eg.db,,,,生物使用,,,,尼特,,,,变体
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 NADFINDER
建议我 atacseqqc,,,,Chippeakanno
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 TrackViewer_1.16.1.tar.gz
Windows二进制 TrackViewer_1.16.1.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) TrackViewer_1.16.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/trackviewer
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/trackViewer
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/trackviewer/
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