此包适用于Bioconductor的3.7版;有关稳定的、最新的发布版本,请参见经验丰富的人。
Bioconductor版本:3.7
stagger包允许对高通量基因表达数据进行自动阶段分析。该方法发表在https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-017-1277-0的基因组生物学上
作者:Koen Van den Berge和Lieven Clement
维护者:Koen Van den Berge < Koen。在gmail.com vdberge >
引文(从R中输入引用(“经验丰富的人”)
):
要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“stage”)
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browseVignettes(“经验丰富的人”)
超文本标记语言 | R脚本 | 分期分析:R .基因高通量表达数据的分期分析 |
参考手册 |
biocViews | 软件,StatisticalMethod |
版本 | 1.2.22 |
许可证 | GNU通用公共许可证第3版 |
取决于 | R (> = 3.4),SummarizedExperiment |
进口 | 方法,统计数据 |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle、方法、Biobase,刨边机,limma,DEXSeq,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | stageR_1.2.22.tar.gz |
Windows二进制 | stageR_1.2.22.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | stageR_1.2.22.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/stageR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/经验丰富的人 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/stageR/ |
包下载报告 | 下载数据 |