此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见spliceSites.
Bioconductor版本:3.7
对RNA-seq数据进行剪接中心分析。
作者:沃尔夫冈·凯泽斯
维护者:Wolfgang Kaisers < Kaisers at med.uni-duesseldorf.de>
引文(从R内,输入引用(“spliceSites”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“spliceSites”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“spliceSites”)
R脚本 | spliceSites | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,蛋白质组学,RNAseq,软件 |
版本 | 1.28.0 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | 方法,rbamtools(> = 2.14.3),refGenome(> = 1.6.0),Biobase,Biostrings(> = 2.28.0) |
进口 | BiocGenerics,杜比环绕声系统,seqLogo,IRanges |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | spliceSites_1.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | spliceSites_1.28.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | spliceSites_1.28.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spliceSites |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/spliceSites |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/spliceSites/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |