spliceSites

DOI:10.18129 / B9.bioc.spliceSites

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见spliceSites

用于从RNA-seq数据中探索对齐间隙位置的生物导体包

Bioconductor版本:3.7

对RNA-seq数据进行剪接中心分析。

作者:沃尔夫冈·凯泽斯

维护者:Wolfgang Kaisers < Kaisers at med.uni-duesseldorf.de>

引文(从R内,输入引用(“spliceSites”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“spliceSites”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“spliceSites”)

PDF R脚本 spliceSites
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpression蛋白质组学RNAseq软件
版本 1.28.0
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(5年)
许可证 GPL-2
取决于 方法,rbamtools(> = 2.14.3),refGenome(> = 1.6.0),BiobaseBiostrings(> = 2.28.0)
进口 BiocGenerics杜比环绕声系统seqLogoIRanges
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 spliceSites_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 spliceSites_1.28.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) spliceSites_1.28.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spliceSites
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/spliceSites
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/spliceSites/
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