飞溅

doi:10.18129/b9.bioc.splatter

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅飞溅

单细胞RNA测序数据的简单仿真

生物导体版本:3.7

Splatter是用于模拟单细胞RNA测序计数数据的软件包。它提供了一个简单的接口,用于创建可重现且有据可查的复杂模拟。可以从真实数据估算参数,并提供功能以比较真实和模拟数据集。

作者:卢克·扎皮亚(Luke Zappia)

维护者:卢克·扎皮亚(Luke Zappia)

引用(从r内,输入引用(“飞溅”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ splatter”)

文档

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html R脚本 溅起包装的介绍
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 基因表达,,,,rnaseq,,,,测序,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学
版本 1.4.3
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(1。5年)
执照 GPL-3 +文件许可证
要看 r(> = 3.4),Singlecellexperiment
进口 阿基马,,,,生物基因,,,,生物比较,,,,检查员,,,,EDGER,,,,fitdistrplus,,,,GGPLOT2,,,,Locfit,,,,矩阵, 方法,,,,,评分(> = 1.7.4),统计,总结性特征,utils,蜡笔
链接
建议 生物使用,,,,COVR,,,,牛仔图,,,,尼特,,,,limsolve,,,,LME4,,,,进步,,,,PSCL,,,,测试,,,,rmarkDown,,,,S4VECTORS,,,,SCDD,,,,斯克兰,,,,MFA,,,,苯酚,,,,基本,,,,Zinbwave,,,,sparsedc
系统要求
增强
URL https://github.com/oshlack/splatter
BugReports https://github.com/oshlack/splatter/issues
取决于我
进口我
建议我 总结
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Splatter_1.4.3.tar.gz
Windows二进制 splatter_1.4.3.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) Splatter_1.4.3.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/splatter
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/飞溅
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/splatter/
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