snpStats

DOI:10.18129 / B9.bioc.snpStats

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅snpStats

SnpMatrix XSnpMatrix类和方法

Bioconductor版本:3.7

类和统计方法对大型SNP研究协会。这扩展了早些时候snpMatrix包,允许基因型的不确定性。

作者:大卫·克莱顿< dc208在cam.ac.uk >

维修工:大卫·克莱顿< dc208在cam.ac.uk >

从内部引用(R,回车引用(“snpStats”)):

安装

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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“snpStats”)

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PDF R脚本 数据输入
PDF R脚本
PDF R脚本 归责和荟萃分析
PDF R脚本 LD统计
PDF R脚本 主成分分析
PDF snpMatrix-differences
PDF R脚本 snpStats介绍
PDF R脚本 TDT)测试
PDF 参考手册

细节

biocViews GeneticVariability,微阵列,单核苷酸多态性,软件
版本 1.30.0
Bioconductor自 BioC 2.8 (r - 2.13)(7.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 2.10.0),生存,矩阵、方法
进口 图形、grDevices统计,跑龙套,BiocGenerics,zlibbioc
链接
建议 hexbin
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 eQTL,GGBase,GGdata
进口我 FunciSNP,GeneGeneInteR,GGtools,gQTLstats,gwascat,ldblock,马提尼,,旅游房车,scoreInvHap
建议我 crlmm,GWASTools,omicRexposome,omicsPrint,VariantAnnotation
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 snpStats_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 snpStats_1.30.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) snpStats_1.30.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/snpStats
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ snpStats
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/snpStats/
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  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网