simpleaff.

DOI:10.18129 / b9.bioc.simpleaffy.

此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本,请参阅simpleaff.

非常简单的Affymetrix数据分析

生物导体版本:3.7

提供高级别的函数来读取贴心.cel文件,表型数据,然后用它计算简单的东西,例如t-tests,折叠变化等。大量使用贴心图书馆。还具有一些基本散点图功能和机制,用于生成高分辨率期刊数据......

作者:Crispin J Miller

维护者:Crispin Miller

引文(从R内,输入引文(“simpleaffy”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“simpleaffy”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

Browsevignettes(“SimpleAffy”)

PDF. r script. SimpleAffy Primer.
PDF. 参考手册
文本 自述

细节

Biocviews. 注解DataImport.不同的亚兴微阵列oneChannel.预处理QualityControl.报告写作软件转录可视化
版本 2.56.0
在生物导体中以来 BIOC 1.6(R-2.1)或更早版本(> 13.5岁)
执照 GPL(> = 2)
依靠 R(> = 2.0.0),方法,UTI,GRDEVICE,图形,统计数据,生物根系(> = 0.1.12),BioBase.敬服(> = 1.33.6),Genefilter.gcrma.
进口 方法,Utils,Grdevices,图形,统计数据,生物根系BioBase.敬服Genefilter.gcrma.
链接到
建议
系统要求
加强
URL. http://www.biocadiond.org.http://bioinformatics.picr.man.ac.uk/simpleaffy/
取决于我 YaqCaffy.
进口我 affyqcreport.Arraymvout.
建议我 yeasyExpressArrayTools.弯头
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包 simpleaffy_2.56.0.tar.gz.
Windows二进制文件 simpleaffy_2.56.0.zip.(32-&64位)
Mac OS x 10.11(El Capitan) simpleaffy_2.56.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/simpleaffy.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包装/ simpleaffy
包短网址 http://biocidodder.org/packages/simpleaffy/
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