seqsetvis.

DOI:10.18129 / b9.bioc.seqsetvis.

此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本,请参阅seqsetvis.

基于基于可视化的下一页排序数据

生物导体版本:3.7

SEQSETVIS启用多个基因组数据集的可视化和分析。虽然SEQSETVIS被设计用于比较Mulitple Chip-SEQ数据集,但是该包装是域名不可行的,允许处理多个基因组坐标文件(床上文件)和信号文件(BigWig文件或BAM堆)。

作者:Joseph R Boyd [Aut,CRE]

维护者:Joseph R Boyd

引文(从R内,输入引文(“SEQSETVIS”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url source(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“Seqsetvis”)

文件

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BROWSEVIGNETTES(“SEQSETVIS”)

HTML. r script. 概述和用例
PDF. 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

Biocviews. chipseq.测序软件可视化
版本 1.0.2
执照 MIT +文件许可证
依靠 r(> = 3.5),ggplot2.
进口 data.table.Eulerr.Genomicranges.,grdevices,网格,绞喉林马, 方法,PNG.rcolorbrewer.RSAMTOOLS.rtracklayer.S4Vectors.,统计数据
链接到
建议 biocfilecache.生物焦Chippeakanno.Covr.电台knRAMAMAMDOW.testthat.
系统要求
加强
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包档案包

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源包 seqsetvis_1.0.2.tar.gz.
Windows二进制文件 seqsetvis_1.0.2.zip.
Mac OS x 10.11(El Capitan) seqsetvis_1.0.2.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/seqsetvis.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ seqsetvis
包短网址 http://biocidodder.org/packages/seqsetvis/
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