此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本,请参阅seqsetvis.。
生物导体版本:3.7
SEQSETVIS启用多个基因组数据集的可视化和分析。虽然SEQSETVIS被设计用于比较Mulitple Chip-SEQ数据集,但是该包装是域名不可行的,允许处理多个基因组坐标文件(床上文件)和信号文件(BigWig文件或BAM堆)。
作者:Joseph R Boyd [Aut,CRE]
维护者:Joseph R Boyd
引文(从R内,输入引文(“SEQSETVIS”)
):
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##尝试http://如果不支持https:// url source(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“Seqsetvis”)
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BROWSEVIGNETTES(“SEQSETVIS”)
HTML. | r script. | 概述和用例 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
Biocviews. | chipseq.那测序那软件那可视化 |
版本 | 1.0.2 |
执照 | MIT +文件许可证 |
依靠 | r(> = 3.5),ggplot2. |
进口 | data.table.那Eulerr.那Genomicranges.,grdevices,网格,绞喉那林马, 方法,PNG.那rcolorbrewer.那RSAMTOOLS.那rtracklayer.那S4Vectors.,统计数据 |
链接到 | |
建议 | biocfilecache.那生物焦那Chippeakanno.那Covr.那电台那kn那RAMAMAMDOW.那testthat. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
源包 | seqsetvis_1.0.2.tar.gz. |
Windows二进制文件 | seqsetvis_1.0.2.zip. |
Mac OS x 10.11(El Capitan) | seqsetvis_1.0.2.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/seqsetvis. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondion.org:包/ seqsetvis |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/seqsetvis/ |
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