scsR

DOI:10.18129 / B9.bioc.scsR

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见scsR．

SiRNA对种子脱靶效应的校正

Bioconductor版本:3.7

修正了全基因组siRNA筛选的种子介导脱靶效应。适合的功能，以识别有效的种子/ mirna和可视化他们的影响也提供在包。

作者:Andrea Franceschini

维护者:Andrea Franceschini < Andrea . Franceschini at isb-sib。ch>， Roger Meier < Roger。Meier在lmsc.ethz。Christian von Mering in imls.uzh.ch>

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“scsR”)

文档

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browseVignettes(“scsR”)

PDF	R脚本	scsR装饰图案
PDF		参考手册

细节

biocViews	预处理，软件
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 2.14 (R-3.1)(4.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 2.14.0)，STRINGdb、方法、BiocGenerics，Biostrings，IRanges，plyr, tcltk
进口	sqldf，哈希，ggplot2，图形，grDevices，RColorBrewer
链接
建议	RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	scsR_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	scsR_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	scsR_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scsR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scsR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/scsR/
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