司康饼

DOI:10.18129 / B9.bioc.scone

此包适用于Bioconductor的3.7版;有关稳定的、最新的发布版本，请参见司康饼。

单单元格规范化表达式数据的概述

Bioconductor版本:3.7

SCONE是一个R包，用于比较和排名单细胞rna测序和其他高通量分析的不同归一化方案的性能。

作者:Michael Cole [aut, cre, cph]， Davide Risso [aut, cph]

维护者:Michael Cole

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“司康”)

文档

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超文本标记语言	R脚本	司康饼装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道,GeneExpression,归一化,预处理,质量控制,RNASeq,测序,SingleCell,软件,转录组
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (R-3.4)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.4)，方法SummarizedExperiment
进口	图形、统计、跑龙套,aroma.light,BiocParallel,类,集群,作文,diptest,刨边机,fpc,gplotsgrDevices,hexbin,limma,matrixStats,mixtools,RColorBrewer,引导,rhdf5,RUVSeq,rARPACK
链接
建议	BiocStyle,DT,ggplot2,knitr,miniUI,NMF,情节,reshape2,rmarkdown,食物,scRNAseq,闪亮的,testthat,visNetwork
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/YosefLab/scone/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	scone_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	scone_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	scone_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scone
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/烤饼
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/scone/
包下载报告	下载数据