该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅Scmeth。
生物导体版本:3.7
可以在此处找到分析甲基化数据的功能。某些功能与单细胞甲基化数据有关,但大多数其他功能都可以用于任何甲基化数据。该工作流程的亮点是综合质量控制报告。
作者:divy kangeyan
维护者:divy kangeyan
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html | R脚本 | 小插图标题 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DNAMETHYLATY,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,Singlecell,,,,软件 |
版本 | 1.0.1 |
执照 | GPL-2 |
要看 | R(> = 3.5.0) |
进口 | GGPLOT2,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,BSSEQ,,,,AnnotationHub,,,,基因组机,,,,RESHAPE2,统计,utils,BSGENOME,,,,延迟(> = 0.5.15),Annotatr,,,,总结性特征(> = 1.5.6),GenomeInfodB,,,,生物弦,,,,DT,,,,ggthemes,,,,秤,,,,维里迪斯,,,,HDF5Array(> = 1.7.5) |
链接 | |
建议 | bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10,,,,bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown,,,,org.hs.eg.db,,,,生物酶,,,,生物基因 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | scmeth_1.0.1.tar.gz |
Windows二进制 | SCMETH_1.0.1.ZIP |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | scmeth_1.0.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scmeth |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/scmeth |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/scmeth/ |
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