Scmeth

doi:10.18129/b9.bioc.scmeth

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅Scmeth

在甲基化数据中进行质量控制分析的功能

生物导体版本:3.7

可以在此处找到分析甲基化数据的功能。某些功能与单细胞甲基化数据有关,但大多数其他功能都可以用于任何甲基化数据。该工作流程的亮点是综合质量控制报告。

作者:divy kangeyan

维护者:divy kangeyan

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文本 消息

细节

生物浏览 DNAMETHYLATY,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,Singlecell,,,,软件
版本 1.0.1
执照 GPL-2
要看 R(> = 3.5.0)
进口 GGPLOT2,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,BSSEQ,,,,AnnotationHub,,,,基因组机,,,,RESHAPE2,统计,utils,BSGENOME,,,,延迟(> = 0.5.15),Annotatr,,,,总结性特征(> = 1.5.6),GenomeInfodB,,,,生物弦,,,,DT,,,,ggthemes,,,,,,,,维里迪斯,,,,HDF5Array(> = 1.7.5)
链接
建议 bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10,,,,bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown,,,,org.hs.eg.db,,,,生物酶,,,,生物基因
系统要求
增强
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取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

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源包 scmeth_1.0.1.tar.gz
Windows二进制 SCMETH_1.0.1.ZIP
Mac OS X 10.11(El Capitan) scmeth_1.0.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scmeth
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/scmeth
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/scmeth/
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