scmap
doi：10.18129/b9.bioc.scmap
该包适用于生物导体的3.7版；对于稳定的最新版本，请参阅scmap。
无监督投影单细胞RNA-seq数据的工具
生物导体版本：3.7
单细胞RNA-SEQ（SCRNA-SEQ）广泛用于研究复杂组织的组成，因为该技术允许研究人员使用转录组的无监督聚类来定义细胞类型。但是，由于实验方法和计算分析的差异，直接比较两个不同实验中鉴定的细胞通常是具有挑战性的。SCMAP是一种将细胞从SCRNA-SEQ实验投射到不同实验中鉴定出的细胞类型或单个细胞的方法。
作者：Vladimir Kiselev
维护者：vladimir kiselev
引用（从r内，输入引用（“ SCMAP”））：
安装
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文档
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| html | R脚本 | `scmap`软件包小插图 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 分类，，，，DataImport，，，，datarepresentation，，，，基因表达，，，，预处理，，，，rnaseq，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件，，，，辅助视摩钦，，，，转录，，，，转录组学，，，，可视化 |
| 版本 | 1.2.0 |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | R（> = 3.4） |
| 进口 | 生物酶，，，，Singlecellexperiment，，，，总结性特征，，，，生物基因，，，，S4VECTORS，，，，dplyr，，，，RESHAPE2，，，，矩阵，，，，代理人，utils，Googlevis，，，，GGPLOT2，方法，统计，E1071，，，，Randomforest，，，，RCPP（> = 0.12.12） |
| 链接 | RCPP，，，，rcpparmadillo |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/hemberg-lab/scmap |
| BugReports | https://support.bioconductor.org/t/scmap/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | scmap_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | scmap_1.2.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | scmap_1.2.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scmap |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/scmap |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/scmap/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
