rhdf5

DOI:10.18129 / B9.bioc.rhdf5

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rhdf5

R HDF5接口

Bioconductor版本:3.7

这个包提供了一个接口HDF5和r . HDF5之间的主要功能是存储和访问的能力非常大的和/或复杂的数据集和各种元数据海量存储器(磁盘)通过一个完全可移植文件格式。rhdf5包是适合大型和/或复杂的交换数据集之间的R和其他软件包,让R应用工作大于可用内存的数据集。

作者:贝恩德•费舍尔(aut),格雷戈勒加索尔(aut),迈克·史密斯(aut (cre),马丁•摩根(施)丹尼尔·范Twisk(施)

维护人员:迈克史密斯<迈克。史密斯在embl.de >

从内部引用(R,回车引用(“rhdf5”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“rhdf5”)

文档

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browseVignettes (“rhdf5”)

HTML R脚本 rhdf5
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImport,基础设施,软件
版本 2.24.0
Bioconductor自 BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 13.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 方法
进口 Rhdf5lib
链接 Rhdf5lib
建议 bit64,BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 GSCA,HDF5Array
进口我 beachmat,biomformat,diffHic,DmelSGI,DOQTL,DropletUtils,h5vc,电离,phantasus,PureCN,,司康饼
建议我 激流回旋,SummarizedExperiment,tximport
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 rhdf5_2.24.0.tar.gz
Windows二进制 rhdf5_2.24.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) rhdf5_2.24.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rhdf5
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rhdf5
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/rhdf5/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网