RFPRED.

DOI:10.18129 / b9.bioc.rfpred.

此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本,请参阅RFPRED.

将RFPRED功能预测分数分配给密码变体列表

生物导体版本:3.7

基于外部众多数据文件,其中RFPRED评分在人体Exome的所有基因组位置进行了预先计算的,该包装将RFPRED分数与染色体,位置(HG19版),参考剂和替代核苷酸和UNIPROT和UNIPROT鉴定的错过变异蛋白质的标识符。请注意,对于使用包,必须在Internet上连接用户或下载TabixFile和索引(大约3.3 Go)。

作者:Fabienne Jabot-Hanin,Hugo Ramet和Jean-Philippe Jais

维护者:Gmail.com的Hugo Ramet

引文(从R内,输入引文(“RFPRED”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Beoclite(“RFPRED”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“RFPRED”)

PDF. r script. 计算rfpredscoreswithpackagerfpred.
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 注解分类软件
版本 1.18.0
在生物导体中以来 BIOC 2.13(R-3.0)(5年)
执照 GPL(> = 2)
依靠 RSAMTOOLS.Genomicranges.绞喉data.table.,并行方法
进口
链接到
建议 生物焦
系统要求
加强
URL. http://www.sbim.fr/rfpred.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包 rfpred_1.18.0.tar.gz.
Windows二进制文件 rfpred_1.18.0.zip.(32-&64位)
Mac OS x 10.11(El Capitan) RFPRED_1.18.0.TGZ.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/rfpred.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ rfpred
包短网址 http://biocidodder.org/packages/rfpred/
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文件»

生物体

R./cr包裹和文件

支持»

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