此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本,请参阅RFPRED.。
生物导体版本:3.7
基于外部众多数据文件,其中RFPRED评分在人体Exome的所有基因组位置进行了预先计算的,该包装将RFPRED分数与染色体,位置(HG19版),参考剂和替代核苷酸和UNIPROT和UNIPROT鉴定的错过变异蛋白质的标识符。请注意,对于使用包,必须在Internet上连接用户或下载TabixFile和索引(大约3.3 Go)。
作者:Fabienne Jabot-Hanin,Hugo Ramet和Jean-Philippe Jais
维护者:Gmail.com的Hugo Ramet
引文(从R内,输入引文(“RFPRED”)
):
要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Beoclite(“RFPRED”)
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“RFPRED”)
PDF. | r script. | 计算rfpredscoreswithpackagerfpred. |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 注解那分类那软件 |
版本 | 1.18.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.13(R-3.0)(5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
依靠 | RSAMTOOLS.那Genomicranges.那绞喉那data.table.,并行方法 |
进口 | |
链接到 | |
建议 | 生物焦 |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | http://www.sbim.fr/rfpred. |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
源包 | rfpred_1.18.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | rfpred_1.18.0.zip.(32-&64位) |
Mac OS x 10.11(El Capitan) | RFPRED_1.18.0.TGZ. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/rfpred. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondion.org:包/ rfpred |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/rfpred/ |
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